目前市场上的HDPE塑料瓶乳饮料的生产方式主要是以二次灭菌为主。即乳饮料在经过超高温杀菌处理、完成灌装封口过程之后，再经过85℃以上温度条件下的15分钟保温灭菌处理。这种加工方式使得产品的受热时间长、能量消耗高，对产品的营养成分保持和风味都有一定的不良影响，基本属于被淘汰的生产方式。但是，由于二次灭菌方式的设备投资少，产品利润率高，其在儿童乳饮料的生产上仍占据主要地位。
热灌装、超洁净灌装这两种生产形式，在PET瓶酸性乳饮料生产上占据着主导地位。乳饮料在经过超高温杀菌之后，在87℃以上的温度条件下灌装到PET瓶内，再经过冷却隧道冷却、形成成品。这种生产方式使得产品的受热时间也比较长；同时要求PET瓶的克重比较高，在形状设计方面也必须有加强筋，以防止瓶体形状在高温灌装后发生改变。
无菌冷灌装技术是近几年在国外兴起的一种先进的灌装生产方式。在采用无菌冷灌装技术进行生产时，乳饮料在经过超高温杀菌后迅速冷却到25℃，在无菌的环境下灌装到杀菌后的PET瓶中。采用无菌冷灌装技术，瓶子的克重可以比热灌装方式降低很多，瓶子的形状也可以灵活设计，不再受到加强筋的限制。同时，无菌冷灌装的乳饮料受热时间短，风味和营养成分可以得到良好的保持，能源消耗相对以上三种生产方式也最为节省。由于无菌冷灌装设备的投资较大，对生产环境和厂房的要求比较严格，国内还暂时没有厂家将无菌冷灌装技术引入酸性乳饮料的生产。
